De museumbunkers liggen beneden bij het Skanderborg Sø in Dyrehaven, waar twee voormalige commandobunkers als museum zijn ingericht. Hier dragen niet alleen panelen en vitrines het verhaal; de ruimtes zelf doen een deel van het werk. De lage, koude ruimtes en de dikke muren geven een fysieke indruk van het complex dat de Luftwaffe tijdens de bezetting als Deens hoofdkwartier gebruikte.
De tentoonstellingen zijn verdeeld in een Deens en een Duits deel. Het Deense deel gaat diep in op Skanderborg en Denemarken tijdens de bezetting, met verhalen over politie, verzetsbeweging, samenwerking met de geallieerden, het dagelijks leven en de rechtsafrekening. Het Duitse deel gaat over de activiteiten in de streek, de bunkerbouw, de generaals, de staf en de taken die vanuit het hoofdkwartier werden uitgevoerd.
Onder de voorwerpen bevinden zich afwerpcontainers voor de verzetsbeweging, resten van geallieerde vliegtuigen en alledaagse voorwerpen uit de bezettingstijd. In de bunkers staat ook een zeldzame Enigma-codeermachine, die een concreet inkijkje geeft in de verborgen communicatie van de oorlog.
Een geluidsdecor met onder meer radioapparatuur, Duitse soldaten en een alarmsituatie maakt de ruimtes indringender zonder de geschiedenis mooier te maken. Het laatste deel van de tentoonstelling gaat over de Duitse vluchtelingen in Flygtningelejren Sølund na de oorlog. Buiten verandert het decor abrupt: de paden, Dyrehaven en het meer liggen op enkele passen van de zware betonnen lichamen.
In de Museumsbunkers staat een exemplaar van de Duitse Enigma-codermachine, tentoongesteld in de voormalige commandobunkers in Skanderborg Dyrehave. De kleine machine behoort tot de objecten die het onzichtbare werk van de oorlog heel dichtbij brengen.
Enigma werd gebruikt door Duitse krijgsmachtdelen om tactische berichten te versleutelen en te ontcijferen. Elke toetsaanslag werd via draaiende wielen en elektrische verbindingen verwerkt, waardoor de letters zich verborgen achter mechaniek, instellingen en gedisciplineerde geheimhouding.
